Педаль сцепления нажми, если пропадет, то точно он.
З.Ы. У меня тоже была такая беда. Поменял маховик, вроде сначала пропало, но потом опять появилось это "чудо". В итоге, исчезло только после замены ЭБУ! Никогда не думал, что из-за мозгов может такой звук появляться в районе сцепления. Спасибо ребятам с сервиса на Варшавке